Маркази обуҳавошиносӣ Агентии обуoавошиносӣ дорои 5 шуъба - шуъбаи пешгўии бодуҳаво, обшиносӣ, агрометеорологӣ, метеорологӣ ва бойгонии иттилоотии обуҳавошиносӣ мебошад.
Шӯъбаи пешгӯии боду ҳавоШӯъбаи гидрологӣШӯъбаи метеорологӣШӯъбаи агрометеорологӣШӯъбаи бойгонии иттилоотии обауҳавошиносӣ